Objectif

Formaliser un réseau de partage de compétences méthodologiques et d’outils logiciels au sein de l'INRA, qui contribue à répondre collectivement aux demandes en provenance des départements scientifiques.

Programme sur deux jours

Public

Destiné aux personnes travaillant dans le domaine de l’extraction et de la gestion des connaissances à partir de documents, chercheurs, développeurs de service et utilisateurs experts, qu'il viennent des départements scientifiques ou de la DISI/IST.

Objectif

Identifier les compétences, les complémentarités, les projets, les collaborations possibles et la structure et le rôle du réseau.

Programme

• 9 h 30 Accueil autour d'un café

• 10 h 00 Ouverture de la journée

• 10 h 15 Tour de table des participants

• 10 h 30 Présentations

  • Constitution d’une terminologie dans le domaine de la santé animale par Marie-Colette Fauré (SA)

  • Réseau lexicométrique et réseau de citation pour la structuration de corpus par Michel Zitt (SAE2)

  • Traçabilité, rédaction et indexation de document d’expertise collective par Claudine Mader (DV/IST)

  • Conception d’une ontologie pour l’indexation de documents scientifiques par Pascal Aventurier (DV/IST)

  • Représentation de connaissance dans le domaine de la panification par Amadou N'Diaye (CEPIA)

• 12 h 50 Déjeuner

• 14 h 20 Présentations (suite)

  • Annotation sémantique de documents scientifiques par Claire Nedellec (MIA)

  • Annotation sémantique de tableaux guidée par une ontologie par Juliette Dibie-Barthélemy (MIA)

  • Analyse de l'incertitude dans l'évaluation des risques alimentaires et conséquences sur la décision publique par Patrice Buche (MIA)

  • Catégorisation automatique de publications INRA par Odile Hologne et Lesya Beaudoin (DV/IST)

• 16 h 05 Pause café

• 16 h 35 Présentations (suite)

  • Co-Développement, Contexte d'Usage et plateforme d'outils d'analyse de corpus en SHS : retour d'expérience par Marc Barbier (SAD), Didier Torny (SAE2) et Olivier Guillaume (SAD)

• 17 h 05 Discussion

  Format et objectifs du réseau. De la liste d’emails, vers un centre de ressource ?
  Animation, séminaires, identification des compétences et domaines d’expertise, partage d’expérience, partage d’outils, de documentation, information sur les projets en cours, …
  

• 18 h 00 Clôture de la journée

• Liste de participants

Public

Destiné aux partenaires potentiels, des départements scientifiques et des services d'appui.

Objectif

Cette journée donne lieu à des présentations de méthodes et de quelques exemples d'applications servant à illustrer l'intérêt, les points forts, les limites, les enjeux scientifiques et économiques, et les difficultés de mise en oeuvre.

Programme

• 9 h 30 Accueil autour d'un café

• 10 h 00 Ouverture de la journée

• 10 h 15 Texte et Connaissance - Quelques éléments méthodologiques par Claire Nédellec

• 11 h 00 Recherche et capitalisation d’information scientifique, exemples d'application

  • Cocitation de noms de gènes, extraction de réseaux de régulation et biologie des systèmes chez Bacillus subtilis par Philippe Bessières (MICA)

  • BioAlvis : recherche sémantique d’information en microbiologie sur MedLine par Robert Bossy (MIA).

  • Conception d'une ontologie pour l'indexation de documents scientifiques par Pascal Aventurier (DV/IST)

• 12 h 30 Pause déjeuner

• 14 h 00 Valorisation et Veille

  • Expertise collective des enjeux et déterminants de la consommation de fruits et légumes, une approche informatisée de la gestion de connaissance par Claudine Mader (DV/IST)

  • Un réseau de gestion collective des brevets des organismes de recherche publics européens dans le domaine des agrobiotechnologies. Résultats; expérience acquise sur la veille technologique et la recherche des brevets. Une proposition de démarche mutualisée de veille documentaire à l'intention des chercheurs. par Bernard Teyssendier (BV)

• 15 h Exemples de besoins

  • Extraction d’information sur les voies métaboliques chez les mammifères (synthèse des lipides) par Pierre Blavy (Phase / INRIA).

  • Trancriptome, Statistiques, Bibliographie et Elongation de l'Embryon Bovin par Isabelle Hue (Phase) (sera représentée)

  • Texte et Connaissance dans le département Cepia (Caractérisation et élaboration des produits issus de l'agriculture) par Paul Colonna (CEPIA)

  • Besoins de reporting de l'institut: exemple d'estimation des moyens consacrés à une thématique diffuse, approchés par la détermination d'un périmètre d'activités construit à l'aide de la recherche textuelle Hubert Pampouille (DSI)

• 16 h 00 Introduction à la table ronde

• 16 h 30 Pause café

• 17 h Table ronde

  Des difficultés d’identification du besoin, de montage et de poursuite de projet, dans un cadre pluridisciplinaire et transversal aux départements. Les réponses à leur apporter.
  Technologies matures et problématiques qui relèvent de la recherche, intégration des approches
  Mutualisation d'outils et de compétence.

• 17 h 45 Clôture de la journée

• Liste de participants