• Nédellec C., Rouveirol C., éditrices des Proceedings of the Tenth European Conference on Machine Learning, (ECML'98), Springer Verlag, avril 1998.

Book chapter

• Nédellec C., Nazarenko A., Bossy R. "Information Extraction", Handbook on Ontology, S. Staab, R. Studer (eds.), Springer Verlag, 2009.

• Nédellec C. et Nazarenko A., " Ontology and Information Extraction: A Necessary Symbiosis", Ontology Learning from Text: Methods, Evaluation and Applications. Volume 123 Frontiers in Artificial Intelligence and Application, P. Buitelaar, P. Cimiano, B. Magnini (eds.), IOS Press, 2005.

• Nédellec C., Machine Learning for Information Extraction in Genomics - State of the Art and Perspectives",Text Mining and its Applications: Results of the NEMIS Launch Conference. Springer Verlag Series: Studies in Fuzziness and Soft Computing. Sirmakessis Spiros (Ed.), p. 99-118, 2004.

• Kayser D., Vosniadou S., Nédellec C., Tiberghien A. et Zucker J. D., Introduction de Knowledge Representation Changes in Humans and Machines, Kayser D. et Vosniadou S. (Eds.), Elsevier Science, 2000.

• Nédellec C., "Corpus-based learning of semantic relations by the ILP system, Asium" in Learning Language in Logic, Cussens J. and Dzeroski S. (Eds.), Springer Verlag, version revue et étendue de l'article paru dans le workshop de même nom, September 2000.

• Nédellec C., Tiberghien A., "Teaching the energy concept with the Machine Learning system APT", in Knowledge Representation Changes in Humans and Machines, Kayser D. et Vosniadou S. (Eds.), Elsevier Science, 2000.

• Nédellec C., Rouveirol C., Adé H., Bergadano F. et Tausend B.,"Declarative Bias in ILP", in Advances in Inductive Logic Programming, p. 82-103, De Raedt L. (Ed.), IOS Press, 1996.

• Saitta L., Chaiklin S., Nédellec C., Neri F., Tiberghien A. et Vergnaud G. "Knowledge Representation Changes in Humans and Machines", in Learning in Humans and Machines: Towards an Interdisciplinary Learning Science, Reimann P. et Spada H. (Ed.), Elsevier Science, 1996.

International journal

• Robert Bossy, Julien Jourde, Alain-Pierre Manine, Philippe Veber, Erick Alphonse, Maarten van de Guchte, Philippe Bessi�res, Claire NŽdellec. (To appear). BioNLP Shared Task - The Bacteria Track. BMC Bioinformatics.

• Nédellec C., "Bibliographical Information Extraction in Genomics" in IEEE Intelligent Systems: Trends & Controversies - Mining Information for Functional Genomics, N. Shadbolt (Ed.), p. 76-78, mai-juin, 2002.

• Nédellec C., Ferreira J.L., Correia J. et Costa E., "Machine Learning Goes to the Bank", in Applied Artificial Intelligence - An International Journal, Special Issue on Machine Learning, vol 8(4), p. 593-615, Kodratoff Y. (Ed.), Taylor & Francis Publishers, octobre 1994.

• Nédellec C., "Integration of Machine Learning and Knowledge Acquisition" in Knowledge Engineering Review, vol 10(1), p. 77-81, Fox J. (Ed.), Cambridge University Press, mars 1995.

• Nédellec C., "Bibliographical Information Extraction in Genomics" in IEEE Intelligent Systems: Trends & Controversies - Mining Information for Functional Genomics, N. Shadbolt (Ed.), p. 76-78, mai-juin, 2002.

• Nédellec C., critique du livre intitulé "Inductive Logic Programming: From Machine Learning to Software Engineering", de Bergadano F. et Gunetti D., MIT Press, in Knowledge Engineering Review, Fox J. (Ed.), Cambridge University Press, 1997.

International conference

• Wiktoria Golik, Pierre Warnier, Claire Nédellec. (2011) Corpus-based extension of termino-ontology by linguistic analysis: a use case in biomedical event extraction. Ontology and Lexicon: new insights. Workshop proceedings of TIA 2011 : 9th International Conference on Terminology and Artificial Intelligence, M. Slodzian et al. ed., Paris.

• Zorana Ratkovic, Wiktoria Golik, Pierre Warnier, Philippe Veber, Claire Nédellec, "BioNLP 2011 Task Bacteria Biotope - The Alvis system", BioNLP workshop joint to ACL, Portland, USA, 2011.

• Robert Bossy, Julien Jourde, Philippe Bessi�res, Maarten van de Guchte, Claire Nédellec, "BioNLP shared Tasks 2011 - Bacteria Biotope", BioNLP workshop joint to ACL, Portland, USA, 2011.

• Pierre Warnier, Claire Nédellec "Sentence Filtering for BioNLP: Searching for Renaming Acts" BioNLP workshop joint to ACL, Portland, USA, 2011.

• Claire Nédellec, Wiktoria Golik, Sophie Aubin, Robert Bossy, "Building Large Lexicalized Ontologies from Text: a Use Case in Indexing Biotechnology Patents", International Conference on Knowledge Engineering and Knowledge Management (EKAW 2010), Lisbon, Portugal, 11th 15th octobre, 2010.

• Galibert O., Quintard L., Rosset S., Zweigenbaum P., Nédellec C., Aubin S., Gillard L., Raysz J.-P., Pois D., Tannier X., DelŽger L., Laurent D., " Named and specific entity detection in varied data: The Quaero Named Entity baseline evaluation", The seventh international conference on Language Resources and Evaluation (LREC-2010), European Language Resources Association (ELRA) publisher, Malte, 19-21 mai 2010.

• Sophie Aubin, Philippe Bessi�res, Robert Bossy, Laurent Gillard, Julien Jourde, Frédéric Papazian, Philippe Veber, Claire Nédellec, BioAlvis II, NLP-based semantic mining of literature on molecular biology of bacteria, p. 41, proc of the Workshop BioCreative II.5, B. Baneres et al. (eds), CNIO Madrid, 7 to 9 October 2009.

• R. Bossy, A. Kotoujansky, S. Aubin and C. Nédellec, Ç Close Integration of ML and NLP Tools in BioAlvis for Semantic Search in Bacteriology Ç , Proceedings of the Workshop on Semantic Web Applications and Tools for Life Sciences, A. Burger, A. Paschke, P. Romano, A. Splendiani (Eds), Edinburgh, United Kingdom, November 28, 2008.

• Bessières P., Bossy R., Mannine A.-P., Alphonse E., Nédellec C., "Getting the Unknown from the Known in Bacteria, and the Role of Text Mining", In Proceedings of the Data and text mining in integrative biology workshop, ECML/PKDD, M. Hilario et C. Nédellec (Eds), p. 67-72, Berlin, Allemagne, septembre 2006.

• Nédellec C., Bessières P., Bossy R., Kotoujansky A., Manine A.-P., "Annotation Guidelines for Machine Learning-Based Named Entity Recognition in Microbiology", In Proceedings of the Data and text mining in integrative biology workshop, ECML/PKDD, M. Hilario et C. Nédellec (Eds), p. 40-54, Berlin, Allemagne, septembre 2006.

• Nazarenko A., Nédellec C., Alphonse E., Aubin S., Hamon T., Manine A.-P., "Semantic Annotation in the Alvis Project", in Proceedings of the International Workshop on Intelligent Information Access, W. Buntine and H. Tirri (eds), Helsinki, Finlande, juillet 2006.

• Aubin S., Nazarenko A. and Nédellec C. "Adapting a General Parser to a Sublanguage", Proceedings of the International Conference on Recent Advances in Natural Language Processing (RANLP'05). Pages 89-93. Borovets, Bulgarie, 2005.

• Alphonse E., Aubin S., Bessières P., Bisson G., Hamon T., Lagarrigue S., Manine A.-P., Nazarenko A., Nédellec C., Ould Abdel Vetah M., Poibeau T., Weissenbacher D., Event-based information extraction for the biomedical domain: the Caderige project. In Proceedings of International Joint workshop on Natural Language Processing in Biomedicine and its Applications (NLPBA/BioNLP COLING'04), Ruch P., Collier N. and Nazarenko A. (eds.), p. 43-49, Geneva, Swiss, 2004.

• Nédellec C., Ould Abdel Vetah M., et Bessières P., "Sentence Filtering for Information Extraction in Genomics, a Classification Problem". In Proceedings of the Principles of Data Mining and Knowledge Discovery, 5th European Conference, PKDD'2001, p. 326-338, Luc De Raedt and Arno Siebes eds, Springer Verlag, Lecture Notes in Computer Science, Freiburg, Germany, September 2001.

• Bisson G., Nédellec C. et Canamero D. "Designing clustering methods for ontology building - The Mo'K workbench" in Proceedings of the workshop on Ontology Learning, workshop of the European Conference on Artificial Intelligence (ECAI-2000), Staab S. et al (Eds)., p. 13-19, Berlin, August 2000.

• Nédellec C., "Corpus-based learning of semantic relations by the ILP system, Asium" in proceedings of Learning Language in Logic workshop, co-located with ICML'99, p. 28-39, Cussens J. (Ed.), Bled, Slovénie, juin 1999.

• Faure D. et Nédellec C.,"Knowledge Acquisition of Predicate-Argument Structures from technichal Texts using Machine Learning" in Proceedings of Current Developments in Knowledge Acquisition: EKAW-99, p. 329-334, Fensel D. et Studer R. (Ed.), Springer Verlag, Karlsruhe, Allemagne, Avril 1999.

• Faure D. et Nédellec C.,"ASIUM: Learning subcategorization frames and restrictions of selection." in Proceedings of the Text Mining workshop, 10th European Conference on Machine Learning (ECML 98), Kodratoff Y. (Ed.), Chemnitz, Allemagne, avril 1998.

• Faure D. et Nédellec C., "A Corpus-based Conceptual Clustering Method for Verb Frames and Ontology Acquisition " in Proceedings of Adapting lexical and corpus resources to sublanguages and applications, workshop of the 1st International Conference on Language resources and Evaluation (LREC), p. 1-8, Velardi P. (Ed.), Grenade, Espagne, Mai 1998.

• Nédellec C., "APT, a cooperative ML System", in Proceedings of the AAAI'96 Spring Symposium on Knowledge Acquisition and Learning by Demonstration , p. 97-103, Cypher A., Gil Y., Pazzani M. (Eds.), AAAI report, Stanford, mars 1996.

• Nédellec C., "Cooperation with a Learning Apprentice", in Proceedings of the First International Conference on Applied Ergonomics (ICAE'96), Özok A. F. (Ed.), p. 497-503, USA Publishing, Istanbul, Mai 1996.

• Feldman R. et Nédellec C., "A Framework for Specifying Explicit Bias for Revision of Approximate Knowledge Bases", in Proceedings of the 7th Knowledge Acquisition Workshop, KAW-94, p. 15.1-19, Gaines B. et Musen M. (Eds.), Banff, janvier 1994.

• Nédellec C. et Rouveirol C., "Hypothesis Selection Biases for Incremental Learning", in Proceedings of the AAAI Spring Symposium on Training Issues in Incremental Learning, Technical Report, A. Cornuejols (Ed.), AAAI Press, Menlo Park, mars 1993.

• Nédellec C., "Knowledge Refinement Using Knowledge Acquisition and Machine Learning Methods", in Proceedings of the AAAI Spring Symposium on Cognitive Aspects of Knowledge Acquisition, Gaines B. (Ed.), Stanford University, Mars 1992.

• Nédellec C. et Causse K., "Knowledge Refinement with KA and ML Methods", in Proceedings of 5th Current Developments in Knowledge Acquisition: EKAW-92, p. 171-190, Wetter T. et al. (Eds.), Springer-Verlag, Mai 1992.

• Nédellec C., "How to specialize by Theory Refinement", in Proceedings of the 10th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI-92), p. 474-478, Neuman B. (Ed.), John Wiley & sons (Pub.), Vienne, août 1992.

• Nédellec C., "A Smallest Generalization Step Strategy" in Proceedings of the Eight International Workshop on Machine Learning (IWML 91), p. 529-533, Evanston (USA), Birnbaum L. A. et Collins G. C. (Eds.), Morgan Kaufman, juin 1991.

Edition of international workshop

• Hilario M. et Nédellec C., Proceedings of the "Data and text mining for integrative biology", workshop of ECML/PKDD, European Conference on Machine Learning, Berlin, Allemagne, 18 September 2006. http://cui.unige.ch/~hilario/ecml-pkdd06-biows/

• Cussens J. et Nédellec C., Proceedings of the Learning Language in Logic ICML joint workshop and the Challenge task, Extracting Relations from Biomedical Texts, Bonn, Allemagne, August 2005.

• Staab S., Maedche A., Nédellec C. et Hovy E., IJCAI Workshop Notes of the Ontology Learning, workshop of the 17th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI), Vancouver, August 2001.

• Cardie C., Daelemans W., Nédellec C. et Tjong Kim Sang E., Proceedings of the Fourth Conference on Computational Natural Language Learning and of the Second Learning Language in Logic Workshop. , Omni Press (Pub.), Lisbonne, septembre 2000.

• Staab S., Maedche A., Nédellec C. et Wiemer-Hastings P., ECAI Workshop Notes of the Ontology Learning, workshop of the 14th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI), Berlin, Août 2000.

• Kodratoff Y. et Nédellec C., Machine Learning and Comprehensibility, workshop of the 14th International Joint Conference on Artificial Intelligence, (IJCAI-95), Montréal, août 1995.

• Kodratoff Y. et Nédellec C., Integration of Machine Learning and Knowledge Acquisition, Actes du workshop of the 11th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI-94), août 1994.

Communications

• Nédellec C. "Learning Language in Logic - Genic Interaction Extraction Challenge" in Proceedings of the Learning Language in Logic (LLL05) workshop joint to ICML'05. Cussens J. and Nedellec C. (eds). p 31-37, Bonn, August 2005.

• Nédellec C., "Machine Learning Applied to Information Extraction in specific domains. An Example: gene interaction extraction from bibliography in genomics.", communication invitée. In Proceedings of the second 2nd ECML/PKDD'2002 Workshop on Semantic Web Mining, Berendt B. et al. (Eds), p. 1-7, Helsinki, Finlande, août 2002.

• Nédellec C., "Knowledge Extraction from Text, a Machine Learning Approach", communication invitée. In Proceedings of the Third International Conference on Human-System Learning, CAPS'3, Learning WWW, Europia Production (Pub.), Paris, France, Décembre 2000.

• Nédellec C., "Modeling Machine Learning and Comprehensibility" in Proceedings of the IJCAI'95 workshop on Machine Learning and Comprehensibility, Montréal, Août 1995.

• Nédellec C. et Rouveirol C., "Shift of Bias for Incremental Learning", in Proceedings of the MLnet workshop on MultiStrategy Learning, Saitta L. (Ed.), Blanès, Espagne, Septembre 93.

• Nédellec C. et Canamero D. "Learning and Problem-Solving with APT", in Proceedings of the MLnet workshop on Problem-Solving and Machine Learning, Van Someren M. (Ed.), Blanès Espagne, Septembre 93.

Vulgarisation

• Nédellec, C. "Automatic metadata production"Content Mining Service, Newsletter technic. 2.0 2006.

• "Activité de MIG en IA et bioinformatique", Bulletin AFIA (Association Fran�aise pour l'Intelligence Artificielle), 2006.

• "MIG-INRA, Activité en IA - le projet Caderige", Bulletin AFIA, 2003.

• "Le projet ExtraPloDocs, EXTRAction de connaissance pour l'EXPLOitation de la DOCumentation Scientifique", Bulletin AFIA, 2003.

Project reports

• Report on Tests, deliverable D8.3 Projet IST-FP6 Alvis, mars 2007.

• Semantic class learning and syntactic resources tuning, deliverable D6.4 Projet IST-FP6 Alvis, mars 2007.

• Prototype and documents for learning and integration of named entities and terminology, deliverable D6.3 Projet IST-FP6 Alvis, mai 2006. Final report on NLP analysis and normalization, deliverable D5.3 Projet IST-FP6 Alvis, mai 2006.

• Prototype and documents for learning and integration of named entities and terminology, deliverable D6.3 Projet IST-FP6 Alvis, mai 2006.

ExtraPloDocs

• Etude de l'existant et des besoins, rapport D2.1 et D2.2 du projet RNTL ExtraPloDocs, fŽvrier 2003.

• Architecture et spécifications fonctionnelles, rapport D2.3 du projet RNTL ExtraPloDocs, juin 2003.

• Acquisition d'une ontologie, rapport D3.2 du projet RNTL ExtraPloDocs, janvier 2005.

• Choix, évaluation et adaptation d'un analyseur syntaxique, rapport D3.3a du projet RNTL ExtraPloDocs, dŽcembre 2003.

• Constitution des données d'apprentissage et de test pour le filtrage de document Rapport D5.1 du projet RNTL ExtraPloDocs, septembre 2004.

• Rapport d'évaluation des méthodes d'apprentissage pour la sélection de fragments pertinents, Rapport D5.2 du projet RNTL ExtraPloDocs, septembre 2004.

• Constitution et annotation du corpus de test pour l'apprentissage de règles d'extraction de connaissances, Rapport D6.1 du projet RNTL ExtraPloDocs, septembre 2004.

• Méthodes pour l'acquisition automatique de règles d'extraction, Rapport D6.2 du projet RNTL ExtraPloDocs, dŽcembre 2005.

• Evaluation des règles d'extraction de connaissance, Rapport D6.3 du projet RNTL ExtraPloDocs, dŽcembre 2005.

MLT (Machine Learning Toolbox)

• Coimbra, ISoft et LRI, Treatment of Hypertension, Tech. Report, Projet Esprit MLT, mai 1991.

• Coimbra, ISoft et LRI, Case Study on Loan Analysis, Tech. Report, Projet Esprit MLT, septembre 1992.

• ISoft, LRI et Coimbra, User's Guide for APT, Deliverable 4.2, 300 pages, Projet Esprit MLT, mars 1993.

• ISoft, LRI et Coimbra, Final Discussion on APT and KBG, Deliverable 4.4, Projet Esprit MLT, mars 1993.

• WP4 MLT partners, "The Learning Tools" in Final Report on Esprit Project Machine Learning Tollbox n° 2154, juin 1993.

• LRI/LIM, Projet Incremental Revision of Relational Models in Robotics and Vision, Rapport d'activité, septembre 1993.

• ILP Declarative Bias Workpackage Declarative Bias, Deliverable DB 3. Projet ILP, Août 1995.

• LRI, Deliverable LRI2. Revision with small example sets, Projet ILP 2, janvier 1998. (Rôle : rédacteur)

• LRI, Deliverable LRI4. Acquisition of semantic knowledge from specification texts by ML methods, the ASIUM system, Projet ILP 2, janvier 1998.

National book chapter

• Coste F., Nédellec C ., Scheix T. Vert J.-P., "IA et Bioinformatique", Encyclopédie de l'intelligence artificielle., Marquis P. et al. (eds.), Cépaduès, to appear.

• Nédellec C. " Apprentissage automatique", EncyclopŽdie de l'Informatique et des syst�mes d'information, J. Akoka et I. Wattiau (eds), p. 1243-1253, Vuibert, 2006.

• Robardet C., Nédellec C., Boulicaut J-F. Fouille de données et analyse du transcriptome. Chapitre 4 de Informatique pour l'analyse du transcriptome, pages 101-141, Herm�s Lavoisier, traité IC2, 2004.

• Nédellec C., "APT, un Système d'Apprentissage Coopératif", in Acquisition et Ingénierie des Connaissances, tendances actuelles, p. 307-327, Reynaud C., Laublet P. et Aussenac N. (Eds.), Cépaduès, 1995.

• Traduction du chapitre "LEAP, a Learning Apprentice for the VLSI Design" de Mitchell T.M., Mahadevan S. et Steinberg L. I. paru dans Machine Learning III, An Artificial Intelligence Approach, Kodratoff Y. et Michalski R. S. (Eds.), Morgan Kaufman, 1990, dans L'apprentissage Automatique : Une Approche Intelligence Artificielle, p. 239-269, Kodratoff Y., Michalski R. S., Carbonell J. G., et Mitchell T. M. (Eds.), Cépaduès Edition, 1993.

National conference

• Alphonse E., Aubin S., Bessières P., Bisson G., Hamon T., Lagarrigue S., Nazarenko A., Nédellec C., Ould Abdel Vetah M., Poibeau T., Weissenbacher D., "Extraction d'information appliquée au domaine biomédical - apprentissage et traitement automatique de la langue", in actes de la Conférence International de Fouille de texte, CIFT-04, Antoni M.-H. et Yvon F. (Eds), La Rochelle, juin 2004.

• Manine A. P., Nédellec C. et Bessières P. (2004). "Application of Machine Learning to knowledge extraction from bibliographical abstracts in functional genomics", JPGD 2004.

• Ould Abdel Vetah M., Nédellec C. et Bessières P., "Application de la classification supervisée au filtrage de phrase mentionnant des interactions géniques dans MedLine", Journées Ouvertes Biologie Mathématique (JOBIM'2002), J. Nicolas & C. Thèrmes (éds), INRIA (pub.), p. 337-341, Saint-Malo, juin 2002.

• Ould Abdel Vetah M., Nédellec C., Bessières P., Caropreso F., Manine A.-P., Matwin S.,"Sentence Categorization in Genomics Bibliography: a Naive Bayes Approach", in Actes de la Journée Informatique et Transcriptome, FJ.-F. Boulicaut et M. Gandrillon (Eds), Lyon, mai 2003.

• Bessières P., Nazarenko N. et Nédellec C., "Apport de l'apprentissage à l'extraction d'information : le problème de l'identification d'interactions géniques.", in Actes du Colloque International sur le Document Electronique, Méthodes, Démarches et Techniques Cognitives, CIDE'2001, Toulouse, octobre 2001.

• Bisson G. et Nédellec C., "Aide à la conception de méthodes de classification pour la construction d'ontologies : l'atelier Mo'K" in Actes des Journées Francophones d'Extraction et de Gestion des Connaissances (EGC'2001), Briand H. (Ed.), Hermès (Pub.), Nantes, Janvier 2001.

• Nédellec C., Ould Abdel Vetah M., Bessières P., Brun C. et Jacq B., "Reconnaître des fragements de phrase pertinents pour l'extraction d'information dans les textes de génomiques, un problème de classification". In Actes de la Conférence Française d'Apprentissage, Bisson G. (Ed.), Grenoble, Juin 2001.

• Faure D., Nédellec C. et Rouveirol C., "Acquisition de connaissances sémantiques par des méthodes d'apprentissage, le système ASIUM" in Actes des 13èmes Journées Françaises d'Apprentissage (JFA'98), Nicolas J. (Ed.), Lens, Mai 1998.

• Faure D., Nédellec C. et Rouveirol C., " Apprentissage automatique de schémas de sous-catégorisation et de restrictions sémantiques à partir de textes" in Actes de la 5ème conférence annuelle sur le traitement automatique des langues naturelles (TALN'98), p 233-235, Zweigenbaum P. (Ed.), Paris, France, Juin 1998.

• Nédellec C., "Configurer différents opérateurs pour contrôler l'exploration d'une base de données relationnelle" in Actes des 12èmes Journées Francophones d'Apprentissage Automatique (JFA-97), Soldano S. (Ed.), Roscoff, Mai 1997.

• Nédellec C., "Expliquer pour valider les systèmes d'apprentissage automatique" in Actes des Journées Acquisition des Connaissances du PRC-GDR-IA (JAC-93), Reynaud C. (Ed.), Saint- Raphaël, Mars 1993.

• Nédellec C., "Un Système d'Apprentissage s'explique", in Actes de la Journée "Explication et Coopération Homme-Machine, vers la co-construction d'explications" (JEEX), Karsenty L. et Brézillon P. (Eds), Paris, Rapport CNAM n°105, Juin 1993.

• Rouveirol C. et Nédellec C., "Les Biais dans la Révision Interactive de Théories" in Actes des 7èmes Journées Apprentissage du PRC-GDR-IA (JFA-93), de Sainte Marie C. (Ed.), Saint-Raphaël, mars 1993.

• Nédellec C., "Une stratégie de généralisation à petits pas pour traiter la surgénéralisation" in Actes des 5èmes Journées Françaises de l'Apprentissage (JFA-91), p. 128-144, Quinqueton J. (Ed.), Sète, Mai 1991.

Edition of national workshop proceedings

• Gallinari P., Jacquemin C. et Nédellec C., Actes de la journée, Apprentissage Statistique et Symbolique pour la Recherche d'Information et la Fouille de Textes, plate-forme AFIA'99 Ecole Polytechnique, Palaiseau, Juin 1999. (Voir http://www.lri.fr/cn/JASSRIFT).

• Nazarenko A. et Nédellec C., Actes de la journée A3CTE, Applications, Apprentissage et Acquisition de Connaissances à partir de Textes Electroniques, plate-forme AFIA'2001, Grenoble, Juin 2001. (Voir http://www-leibniz.imag.fr/AFIA).

• Nédellec C. et Zweigenbaum P., Actes de la journée Apprentissage, connaissances sémantiques et textes, atelier associé à la plate-forme AFIA'2003, Laval, Juin 2003.

National communications

• Nédellec C. et Nazarenko A., " Application de l'apprentissage à la recherche et à l'extraction d'information - Un exemple, le projet Caderige : identification d'interactions géniques.". Communication invitée. In Actes de la Journée thèmatique Exploration de données issues d'Internet, organisé par Bennani Y., Janvier E., Kanawati R. et Salotti S., LIPN-CNRS, Institut Galilée, Université Paris 13, Villetaneuse, Mars 2001.

• Nédellec C. et Ould Abdel Vetah M.,"Modélisation des interactions géniques à partir de textes.", Journée Post-Génomique de la Doua (JPGD), Lyon, Avril 2001.

• Bessières P., Bisson G., Nazarenko A., Nédellec C., Ould Abdel Vetah M. et Poibeau T, "Ontology learning for information extraction in genomics bibliography - the Caderige project", Journées IMPG Ontologie et Extraction d'Information en Génomique, Grenoble, Mai 2001.

• Nédellec C. et Ould Abdel Vetah M., Bessières P., Brun C. et Jacq B., "Text filtering for information extraction in genomics, a classification problem". Journées IMPG Ontologie et Extraction d'Information en Génomique, Grenoble, Mai 2001.

Theses

• Nédellec C., "APT, apprentissage interactif de règles de résolution de problème en présence de théorie du domaine", thèse en informatique de l'Université Paris-Sud. Rapporteurs : J. F. Perrot, (LIP6, Université Paris VI, Paris) et F. Bergadano, (Université de Turin).

Reports

• C. Nédellec, A. Nazarenko, Ontologies and Information Extraction Rapport LIPN, hal-00098068, 2005.

• C. Nédellec, C. Rouveirol. Specifications of the HAIKU system, Rapport de Recherche n° 928 de l'Université Paris-Sud, septembre 1994. C. Nédellec, C. Rouveirol. Biases in interactive theory revision. Rapport de Recherche n° 797 de l'Université Paris-Sud, décembre 1992. Nédellec C. Smallest generalization step strategy to deal with over generalization, Rapport de recherche n° 626, Université de Paris-Sud, 1990.

Main publications of students

• Ferreira J.L., Correia J., Jamet T., Costa E., "An Application of Machine Learning in the Domain of Loan Analysis", in Proceedings of the European Conference on Machine Learning (ECML-93), p. 414-419, Brazdil P. (Ed.), Springer-Verlag, Avril 1993.

• Poittevin L., "Représentation des Connaissances par Nodules de Situation", in Actes du 2ème Colloque des Jeunes Chercheurs en Science Cognitive, p. 354-357, Cognito Ergo Sum, In Cognito & ARC, Giens, Juin 1996.

• Poittevin L., "Comprendre pour réviser : comment la situation peut-elle s'expliquer ?", in Actes des 3èmes Journées Explication , p. 31-243, Joab M. et Giboin A. (Eds.), Juan Les Pins, 1996.

• Poittevin L., "REVINOS : Un outil de révision interactive s'appuyant sur la notion de situation", in Actes des Journées Ingénierie des Connaissances (ex JAC), Zacklad M. (Ed.), 1997.

• Poittevin L., "REVINOS: An Interactive Revision Tool Based on the Concept of Situation", in Proceedings of the 10th European Knowledge Acquisition Modeling and Management Workshop (EKAW'97), Plaza E. et Benjamins R. (Ed.), p. 365-370, Springer Verlag, Espagne, Octobre 1997.

• Poittevin L., "Representing the situations to help the cooperative revision", in Proceedings of the 11th Knowledge Acquisition Workshop (KAW'98), Gaines B. (Ed.), Banff, Canada, Avril 1998.

• Poittevin L., "Un outil générique de conception et de révision coopérative de Bases de Connaissances s'appuyant sur la notion de situation", Thèse en informatique de l'Université Paris-Sud, soutenue le 11 septembre 1998. Rapporteurs, M. C. Haton (LORIA) et J. Breuker (Univ. Amsterdam).

• Faure D., "Acquisition de cadres de sous-catégorisation de verbes et d'ontologies par une méthode de classification", in Actes des 4èmes Rencontres Nationales des Jeunes Chercheurs en Intelligence Artificielle (RJCIA), Marquis P. (Ed.), Toulouse, Septembre 1998.

• Faure D., "ASIUM: quelques expérimentations préliminaires" in Actes de la Journée Apprentissage Statistique et Symbolique pour la Recherche d'Information et la Fouille de Textes, Gallinari P., Jacquemin C. et Nédellec C. (Eds), Juin 1999.

• Faure D. et Poibeau T., "Extraction d'information utilisant Intex et des connaissances sémantiques apprises par Asium, premières expérimentations " in actes du 12ème Congrès Francophone AFRIF-AFIA de Reconnaissance des Formes et Intelligence Artificielle (RFIA'2000), Schmitt F. et Bloch I. (Eds.), Paris, Février 2000.

• Faure D. et Poibeau T., "First experiments of using semantic knowledge learned by ASIUM for information extraction using INTEX", in Proceedings of the workshop on Ontology Learning, workshop of the European Conference on Artificial Intelligence (ECAI), Staab S. et al. (Eds), Berlin Août 2000.

• Faure D., "Conception de méthodes d'apprentissage symbolique et automatique pour l'acquisition de cadres de sous-catégorisation de verbes et de connaissances sémantiques à partir de textes : le système Asium.", Thèse en informatique de l'Université Paris-Sud, soutenue le 20 Décembre 2000. Rapporteurs, A. Nazarenko (LIPN) et A. Napoli (LORIA).

• Abdel Vetah M. O. (2005). Apprentissage automatique appliquét à l'extraction d'information à partir de textes biologiques. Thèse d'informatique de l'Université d'Orsay, soutenue le 21 septembre 2005, France. Rapporteurs, Pascale Sébillot (INRIA) et Stan Matwin (Univ. Ottawa).

• Alain-Pierre Manine (2006). Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique. Thèse d'informatique de l'Université d'Orsay, France. Soutenue le 25 juillet 2006. Rapporteurs, James Cussens (Univ York), Patrice Enjalbert (Univ. Caen).