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- Special issue of BMC Bioinformatics on BioNLP Shared Task 2011.
- Bioinformatics Journal, Elsevier Science (Pub.). Special Issue BioCreative III, 2010.
- Intelligent Data Analysis - An International Journal, F. Famili (Ed.), Elsevier Science (Pub.). 1996 - 2007. IOS Press Publisher since 1999.
- READ - Revue Électronique, l'Apprentissage par les Données, G. Venturini (Ed.), area "Apprentissage Automatique et Interactivity". 1996 - 2000.
- The semantic web, Electronic Transaction on Artificial Intelligence, G. Schreiber (Ed.). 2000-2001.
- Numéro spécial de la revue Document Numérique (HERMES LAVOISIER) sur la fouille de textes, J.-M. Pinon (Ed.), 2003.
- No spécial I3 textes et RTO, Textes et ressources terminologiques et/ou ontologiques : évolution et maintenance (2006).