Laurent Tournier
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Depuis septembre 2009, je suis chargé de recherches en mathématiques appliquées à l'INRA de Jouy en Josas, au sein de l'unité MIG (Mathématiques, Informatique et Génome) du département MIA (Mathématiques et Informatique Appliquées). Mes travaux de recherche concernent la biologie des systèmes (ou biologie systémique, ou encore Systems Biology). Plus particulièrement, je m'intéresse au fonctionnement dynamique de réseaux de régulation provenant des sciences du vivant (réseaux génétiques par exemple). Mon but principal est de modéliser des mécanismes biologiques complexes grāce à des systèmes dynamiques (continus, discrets ou hybrides), et de fournir des outils mathématiques et algorithmiques permettant d'analyser, qualitativement et quantitativement, leurs comportements.

Mots-clés :
Systèmes dynamiques ; équations différentielles ; réseaux booléens ; réduction de modèles ; inférence de réseaux ; modélisation ; biologie des systèmes.
Apoptose ; mort cellulaire ; réponse au stress (bactéries).

Coordonnées
Institut National de la Recherche Agronomique
Unité MIG - Mathématique, Informatique et Génôme Mail : laurent.tournier 'at' jouy.inra.fr
Domaine de Vilvert, Bâtiment 233 Tel : +33(0)1.34.65.28.80
78350 Jouy en Josas Fax : +33(0)1.34.65.29.01

Parcours
Depuis 09/2009 : Chargé de recherches 2ème classe à l'INRA (centre de Jouy en Josas), au sein de l'unité MIG (Mathématique, Informatique et Génôme), dans le groupe de Biologie des Systèmes.
12/2008 -- 08/2009 : Post-doctorant à l'Institut Curie, au sein de l'unité de Bioinformatique, dans l'équipe Computational Systems Biology of Cancer.
09/2006 -- 11/2008 : Post-doctorant à l'INRIA (centre de Sophia-Antipolis), au sein de l'équipe COMORE (Contrôle et Modélisation de Ressources Renouvelables).
09/2004 -- 08/2006 : ATER en informatique à l'Université Pierre Mendès-France (Grenoble 2).
09/2001 -- 08/2004 : Doctorant en mathématiques appliquées au Laboratoire Jean Kuntzmann (ex-LMC) de Grenoble, sous la direction de Jean Della Dora.
Moniteur en informatique à l'Université Pierre Mendès-France (Grenoble 2).

Publications
[Chaves et al, 2010]
M. Chaves, L. Tournier and J.-L. Gouzé,
Comparing Boolean and piecewise affine differential models for genetic networks.
Acta Biotheoretica, 58(2), pp 217-232 (2010).
[Version rapport de recherche disponible]

[Calzone et al, 2010]
L. Calzone, L. Tournier, S. Fourquet, D. Thieffry, B. Zhivotovsky, E. Barillot and A. Zinovyev,
Mathematical modelling of cell-fate decision in response to death receptor engagement.
PLoS Computational Biology, 6(3): e1000702 (2010).

[Tournier and Chaves, 2009]
L. Tournier and M. Chaves,
Uncovering operational interactions in genetic networks using asynchronous boolean dynamics.
Journal of Theoretical Biology, 260(2), pp 196-209 (2009).
[Version rapport de recherche disponible]

[Tournier and Gouzé, 2008]
L. Tournier and J.-L. Gouzé,
Hierarchical analysis of piecewise affine models of gene regulatory networks.
Theory in Biosciences, 127(2), pp 125-134 (2008).
[Version rapport de recherche disponible]

[Tournier and Gouzé, 2008]
L. Tournier and J.-L. Gouzé,
Qualitative Stability Patterns for Lotka-Volterra Systems on Rectangles.
LNCS, Hybrid Systems: Computation and Control 2008, 4981, pp 662-665 (2008).
[Version rapport de recherche disponible]

[Della Dora et al, 2006]
J. Della Dora, A. Maignan, L. Tournier,
Dynamic systems: an algorithmic point of view.
Dumas eds: Transgressive Computing 2006, pp 3-14 (2006).

[Tournier, 2005]
L. Tournier,
Approximation of dynamical systems using S-systems theory: application to biological systems.
Kauers eds: International Symposium on Symbolic and Algebraic Computation, ACM Press, pp 317--324 (2005).
[Version rapport de recherche disponible]

[Tournier, 2005]
L. Tournier,
Étude et modélisation mathématique de réseaux de régulation génétique et métabolique.
PhD Thesis, Institut National Polytechnique de Grenoble (2005).
[Version téléchargeable ici]