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Laboratoire Mathématique, Informatique et Génome, Equipe Bibliome

Participation et coordination de contrats nationaux et internationaux



    Responsabilité et participation scientifique à des Contrats de Recherche Internationaux

  • Montage et coordination pour MIG de Quaero – Automatic multimedia content processing. Oseo. Mai 2008 à décembre 2013. Coordination du WP3 : Natural Language Processing du Core Technology Cluster et des deux tâches 3.3 : Ontology et 3.4 : Semantic Annotation Participation aux projets Corpus et TIAE (Text and Image Annotation Engine) avec la société Jouve. MIG : 20 homme années.

  • Participation au projet européen Specific Support Action, Priority Food quality and safety "Epipagri": Towards European Collective Management of Public Intellectual Property for Agricultural Biotechnologies. WP1 : joint intellectual property information system. Subvention MIG : 9 homme-mois. 2007-2008.

  • Participation au projet européen Transys A systems approach to defining membrane protein networks and applications. Contrat européen Marie Curie ITN-FP7 (2008-2012) Participation à Research Topic 4. Modelling interactions and networks. Voir : . Organisation de la training session text-mining (1 semaine juin 2009).

  • Coordination pour MIG du contrat IST FP6 STREP "ALVIS - Superpeer Semantic Search Engine". Thèmes de recherche : apprentissage de connaissances pour l'enrichissement de documents pour la recherche d'information. Responsabilité du WP Semantics Learning. De 2003 à 2006.

  • Participation pour le LRI au contrat Esprit IV Long Term Research no 20237 "Inductive Logic Programming 2" (18 hommes an). Thèmes de recherche : Application de systèmes de PLI configurable au "Data Mining" - Application de la PLI au traitement du langage naturel - Révision en PLI. De 1996 à juin 1999.

  • Participation au projet European Science Foundation "Learning in Human and Machine" (80 personnes) dans le groupe Changing Representation dirigé par Lorenza Saitta. Thème de recherche : Application du système APT à l'étude des changements cognitifs de représentation chez des étudiants en physique. De 1995 à 1997.

  • Coordination pour le LRI du contrat CNRS bilatéral entre le LRI et le Laboratoire d'Informatique et de Mathématique de l'Université de Bar Ilan (Israël) "Incremental Revision of Relational Models in Robotics and Vision", sous la direction de Y. Kodratoff et de M. Golumbic (6 personnes). Thème de recherche : Utilisation des biais pour la révision des connaissance. De 1992 à 1994. Participation à la suite du contrat de 1995 à 1998 sur le thème fouille de textes.

  • Participation au contrat Esprit III "Basic Research Action" no 6020 "Inductive Logic Programming" sous la direction de C. Rouveirol (LRI), pour la tâche "Declarative Biases" (4 partenaires, 22 hommes an).Thème de recherche : PLI et systèmes configurables. Coordination de la rédaction du rapport final de la tâche. De 1992 à 1994.

  • Participation au contrat Esprit II Machine Learning Toolbox no 2154 (115 hommes année) pour les partenaires LRI et ISoft en tant que responsable de la coordination de la tâche "algorithmes d'apprentissage" (8 partenaires, 43 hommes an) et responsable de la recherche et du développement pour le système d'apprentissage coopératif APT. Production de documents de synthèse et démonstrations à ECAI'90, Esprit Technical Week 90 et 92 (Bruxelles), Journées Systèmes Experts 91, (Avignon), et IJCAI'93. De 1990 à 1993.

  • Coordination pour le LRI du contrat bilatéral CNRS/JNICT "Disciple, un système apprenti, engageant le LRI et le Laboratoire d'Informatique de l'Université de Coimbra (Portugal) sous la direction de Y. Kodratoff et de E. Costa (6 personnes).Thème de recherche : Application bancaire. De 1990 à 1993.

    Participation à des Réseaux d’Excellence Européens

  • Membre du bureau du MLNet (Machine Learning Network), réseau d'excellence Esprit V en apprentissage automatique, en tant que représentante du noeud principal LRI. juin 1999 à 2001.

  • Membre de KDNet: Knowledge Discovery Network of Excellence. FP5-IST-2001-33086 (2002-2005).

  • Membre de KDubiq: Ubiquitous Knowledge Discovery Network of Excellence. FP6-IST -021321 FET Open (Future and Emerging Technologies).(2005-2008).

    Responsabilité de et participation scientifique à des Contrats de Recherche Nationaux

  • Montage et coordination pour MIG du contrat FSOV: Sélection du blé assistée par marqueur. Membre du comité de pilotage. Partenaires : UFS (Union française des semenciers), Arvalis, UMR INRA Génétique, Diversité et Ecophysiologie des Céréales. Objectif de MIG : extraction des information de relation marqueur – variété – phénotype. 1 homme-an. déc 2010 – nov 2011.

  • Etude préalable à la conception d’un système d’information sur les grandes cultures avec des fonctions de recherche sémantique d’information GIS HP2E (Systèmes de production de Grande Culture à Hautes Performances Economiques et Environnementales) (2011-2012)

  • Coordination pour MIG du contrat 3BCAR (bioénergie, biomolécules et biomatériaux du carbone renouvelable) Astrali : Analyse Stratégique sur les Liquides Ioniques : De leur conception à leurs applications dans un contexte de développement durable et d’innovation. Objectif pour MIG : conception d’un système de recherche bibliographique. 6 hommes-mois. 2010-2011.

  • Coordination pour MIG du contrat ANR ARP (atelier de recherche prospective) VegA : Quelles biomasses pour le futur? . février 2008 - janvier 2010. Objectif de MIG : réalisation d’un système d’information de recherche de brevet dans le domaine des biotechnos vertes.

  • Participation au projet Décrypton Cancer du rein et phosphorylation oxydative avec le CGMC (Université C. Bernard Lyon). Subvention : 3 homme-mois. De 2006-2008.

  • Coordination pour MIG du contrat RNTL (Réseau National de Recherche en Technologie Logicielle), "EXTRAction de connaissance pour l'EXPLOitation de la DOCumentation Scientifique, Extraplodocs", avec le laboratoire mixte CNRS-Université Paris 13, LIPN (Laboratoire d'Informatique de Paris-Nord) et la société ISOFT. Responsable des tâches Acquisition d’ontologie et Extraction d’information. Subvention : 181 Keuros. De 2003 à 2005.

  • Coordination pour MIG du contrat bio-informatique inter-EPST, intitulé "CADERIGE 2", avec les laboratoires mixtes CNRS LEIBNIZ (Grenoble), LIPN (Villetaneuse) et LRI (Orsay), le projet INRIA AIDA (Rennes), le laboratoire INRA Rennes et MIG (Versailles). Thème de recherche de MIG : Apprentissage d'ontologie à partir de textes sur le génome. De Novembre 2001 à Novembre 2003, 2ans.

  • Coordination pour le LRI du contrat bio-informatique CNRS-INRA-INRIA-INSERM, "CADERIGE, Catégorisation Automatique de Documents pour l'Extraction de Réseaux d'Interaction Géniques", avec les laboratoires mixtes CNRS LEIBNIZ (Grenoble), LIPN (Villetaneuse), le projet INRIA AIDA (Rennes), les laboratoires INRA GM et LRV (Jouy-en-Josas) et MIG (Versailles). Thème de recherche du LRI : Apprentissage de connaissances linguistiques conceptuelles à partir de textes sur le génome. De Novembre 2000 à Octobre 2001, 1 an.

  • Coordination pour le LRI du contrat RNRT (Réseau National de Recherche en Télécommunication) pré-compétitif financé par Ministère de l'Industrie, "ASTUXE, Amélioration des Services d'Assistance Technique en Ligne par l'Extraction d'Information des Messages de Demande d'Intervention" (16 hommes an dont 3,5 et 1MF pour le LRI). Thème de recherche du LRI : Apprentissage de règles d'extraction de connaissance à partir de textes. De novembre 2000, à avril 2002, 30 mois.

    Responsabilité et Participation scientifique à des Projets de Recherche locaux

  • Participation au thème Apprentissage Automatique et Traitement des Connaissances. animé par J. S. Liénard du projet pluriformation du Département Informatique de l'Université Paris XI. Thèmes de recherche : Application de l'apprentissage automatique au traitement du langage naturel à l'aide de bases de données relationnelles. Durée 2 ans : 1996-1997.

  • Co-responsabilité avec Christian Jacquemin, du projet Bonus Qualité Recherche (BQR), "Construction automatique de thésaurus et d'index à partir de corpus" du Département Informatique de l'Université Paris XI. Durée 1 an : 1999-2000. Collaboration prolongée en 2001.

  • Participation à l’AIP (action incitative programmée) Contractualisation de l’Activité Scientifique et Technique entre l’INRA et les partenaires du développement agricole et territorial, AIP 258, INRA, 2002-2003.

  • Participation à l’AIP (action incitative programmée) Texte et Connaissance, animée par Bruno Goffinet (Chef de département MIA) 2010 -2011.

    Organisation d'une manifestation Industrie-Recherche

  • Organisation scientifique de la Première Rencontre FIIFO (Formation d'Ingénieur en Informatique de la Faculté d'Orsay) Recherche-Industrie sur le thème de la "Gestion documentaire", Orsay, 10 novembre 1999.

    Partenariats Industriels Nationaux hors contrats de recherche institutionnels

  • Montage et responsabilité de la collaboration avec le département R&D de Dassault Aviation sur l'application de l'apprentissage automatique à l'analyse sémantique de textes techniques. Durée 2 ans : 1996-1998. Officialisation du partenariat à travers le End-User Club du projet Esprit ILP 2.

    Valorisation de la recherche

  • Dépôt du logiciel ASIUM par le CNRS auprès du CNISF (no 15072), dans le cadre d'un dossier de valorisation (no 61560) géré par FIST (France Innovation Scientifique et Transfert). Les co-inventeurs sont David Faure, Claire Nédellec et Céline Rouveirol. Depuis 1998.

    Encadrement de thèses CIFRE

  • Collaboration avec la société Valigen sur l'application de méthodes d'apprentissage automatique et de traitement automatique de la langue appliquées à l'extraction de connaissances sur les interactions géniques dans les notices de Medline. Cette collaboration donne lieu à la CIFRE de Mohammed Ould Abdel Vetah. juillet 2000 - juillet 2002.

  • Collaboration avec le service d'Assurance Maladie et de Retraite de la SNCF, Marseille pour la réalisation et la maintenance de la base de connaissance d'un serveur Minitel par des méthodes d'apprentissage coopératives. Cette collaboration a donné lieu à la CIFRE de Luc Poittevin. Durée 4 ans : 1994-1998. Le serveur minitel et l'outil de maintenance sont en service depuis mai 96.