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Thèses / Ph.D.'s Theses --- Habilitations



Thèses/PhD theses:


En cours / In preparation
[28] Bérard, C. Utilisation de données à haute densité pour l'annotation des génomes. PhD thesis, ABIES / AgroParisTech.
[27] Volant, S. Modèles statistiques pour l'analyse des données transcriptome d'origine tilling-array. PhD thesis, ABIES / AgroParisTech.
[26] Latouche, P. Classes empiétantes et modèles de mélange de graphes. PhD thesis, Université d'Evry-val-d'Essonne.
[25] Devillers, H. Statistiques des alignements de génomes complets. PhD thesis, Université d'Evry-val-d'Essonne.
[24] Rigaill, G. Analyse statistique de données à haut débit sur les protéïnes kinase : application au cancer. PhD thesis, ABIES / AgroParisTech.
[23] Grelaud, A. Identification des pressions de sélection qui s'exercent sur des gènes. PhD thesis, Université Paris IX, Dauphine.
[22] Finkler, A. Modèles d'évolution nucléotidique à contexte dépendant. PhD thesis, Université Louis Pasteur, Strasbourg.
[21] Zanghi, H. Classification automatique incrémentale de documents hypertextuels. PhD thesis, Université d'Evry
Soutenues / Defended
[20] Bourguignon, P.-Y. (2008) Utilisation des chaînes de Markov à longueur variable pour l'étude de séquences biologiques. PhD thesis, Université d'Evry.
[19] Célisse, A. (2008) Tests multiples et validation croisée. PhD thesis, Mathématiques de la région Paris-Sud / Université Paris 11. [ .pdf ]
[18] Vergne, N. (2008). Chaînes de Markov régulées et approximation de Poisson pour l'analyse de séquences biologiques. PhD thesis, Université d'Evry-Val-d'Essonne. [ http ]
[17] Roquain, E. (2007). Motifs exceptionnels dans des séquences Hétérogènes. Contributions à la théorie et à la méthodologie des tests multiples. PhD thesis, Université Paris XI.
[16] Lebre, S. (2007). Analyse de processus temporel d'expression de gènes. PhD thesis, Université d'Evry-Val-d'Essonne.
[15] Guedj, M. (2007). Méthodes statistiques pour l'analyse des données génétiques d'association à grande échelle. PhD thesis, Université d'Evry. [ .pdf ]
[14] Mary-Huard, T. (2006). Classification supervisée par SVM: application aux microarrays. PhD thesis, Université de Paris XI.
[ .pdf ]
[13] Touyar, N. (2006). Etude statistique des répétitions dans des séquences biologiques. PhD thesis, Université de Rouen.
[12] Picard, F. (2005). Process segmentation/clustering. Application to the analysis of CGH microarray data. PhD thesis, Université de Paris XI.
[ .pdf ]
[11] Martin, J. (2005). Prédiction de la structure locale des protéines par des modèles de chaînes de Markov cachée. PhD thesis, Université Paris 7.
[ .pdf.gz ]
[10] Richard, H. (2005). Problèmes de classification sur les séquences biologiques : prédiction de la localisation cellulaire des protéines. PhD thesis, Université d'Evry.
[ http ]
[9] Robelin, D. (2004). Détection de courts segments inversés dans les génomes - méthodes et applications. PhD thesis, Université d'Evry.
[ http ]
[8] Gusto, G. (2004). Estimation dans un modèle de Hawkes et application à l'étude de la corépartition de motifs le long d'un génome. PhD thesis, Université Paris XI.
[7] Nicolas, P. (2003). Mise au point et utilisation de modèles de chaînes de Markov cachées pour l'étude des séquences d'ADN. PhD thesis, Université d'Evry.
[6] Nuel, G. (2001). Grandes déviations et chaînes de Markov pour l'étude des mots exceptionnels dans les séquences biologiques. PhD thesis, Université d'Evry.
[ .ps.gz ]
[5] Thébaud, O. (2001). Chaînes de Markov dérivantes et analyse de l'hétérogénéité du génome. PhD thesis, Université de l'Université René Descartes, Paris V.
[ .html ]
[4] Mercier, S. (1999). Statistiques des scores pour l'analyse et la comparaison de sequences. PhD thesis, Université de Rouen.
[ .ps.gz ]
[3] Muri, F. (1997). Comparaison d'algorithmes d'identification de chaînes de Markov cachées et application à la détection de régions homogènes dans les séquences d'ADN. PhD thesis, Université René Descartes, Paris V.
[ .ps.gz ]
[2] Nicodeme, P. (1997). Alignement avec des Familles de Séquences Protéiques. PhD thesis, Université Denis Diderot, Paris VII.
[ .ps.gz ]
[1] Schbath, S. (1995). Étude asymptotique du nombre d'occurrences d'un mot dans une chaîne de Markov et application à la recherche de mots de fréquence exceptionnelle dans les séquences d'ADN. PhD thesis, Université René Descartes, Paris V,.
[ .ps.gz ]

Habilitations:


[3] Matias, C. (2008). Statistique asymptotique dans des modèles à variables latentes.
Habilitation à Diriger des Recherches, Université d'Evry Val d'Essonne.
pdf (french)
[3] Nuel, G. (2006). PMC pour les occurrences de motifs dans les séquences markoviennes
Habilitation à Diriger des Recherches, Université d'Evry Val d'Essonne.
[2] Schbath, S. (2003). Deux approches mathématiques de l'analyse des génomes : statistiques des comptages de mots et prédictions en cartographie physique.
Habilitation à Diriger des Recherches, Université d'Evry.
Compressed PS (french)
Two mathematical approaches to genome analysis: statistics of word counts and prediction in physical mapping
Compressed PS (english)
[1] Robin, S. (2002). Répartition de motifs dans des séquences d'ADN. Habilitation à Diriger des Recherches, Université d'Evry.
Motifs distribution in DNA sequences.
Compressed PS (in french but includes published papers in english)

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Copyright: © SSB (tous droits réservés)
Author:    Sophie Schbath <schbath@ jouy.inra.fr>
Modified:  2007-09-17