Communications autres que les séminaires en France
Communications except from French seminars
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Fast approximate motif statistics,
Nicodème, P.
Biometrische Analyse Molekularer Marker,
Heidelberg, Germany, November 22-24.
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Distribution of word counts in DNA sequences and quality of
approximations,
Schbath, S.,
EMS'2001, 23rd European Meeting of Statisticians,
Funchal, Madeira, August 13-18.
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The impact in life science of recent progress in statistics and
mathematics,
de Turckheim, E.,
BIOMETRICS Conference,
Wageningen, The Nederlands, June 20.
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Statistical results in "in silico" analyses of sequences,
Robin, S.,
Computational Molecular Biology at EURANDOM,
Eindhoven, The Netherlands, January 15-17.
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Efficient tools in Molecular Biology based on statistics and
algorithmics,
de Turckheim, E.,
Computational Molecular Biology at EURANDOM,
Eindhoven, The Netherlands, January 15-17.
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Distributions des occurrences de mots dans une séquence d'ADN,
Robin, S.,
Journée de Génomique,
Institut Elie Cartan de Nancy / INRIA Lorraine, March 29.
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Back to the local score in the logarithmic case: a direct and simple
proof,
Daudin, J.J.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Modèles markoviens dans l'analyse statistique des séquences,
Schbath, S.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Distributions exactes de motifs dans des séquences biologiques,
Robin, S.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Regexpcount, a symbolic package for counting problems on regular
expression and words,
Nicodème, P.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Segmentation des génomes bactériens par chaînes de Markov cachées :
application à la recherche de transferts de gènes sur les chromosomes
de B. subtilis et E. coli,
Nicolas, P.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Grandes Déviations et chaînes de Markov : occurrences de mots
ou de familles de mots,
Nuel, G.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Deux nouvelles approches pour évaluer le score local de séquences
biologiques,
Mercier, S.,
Journées TAS, Traitement et Analyse de Séquences,
Evry, France, Nov. 22-24.
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Exact distribution of word occurrences in DNA sequences,
S. Robin,
Journées MAS, Phénomènes et méthodes stochastiques,
Rennes, France, Sept. 6-8.
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Exact distribution of word occurrences in DNA sequences,
S. Robin,
Garchy Seminar on Mathematical Statistics and Applications,
Garchy, France, Aug. 27 - Sept. 1.
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Exact distribution of word occurrences in DNA sequences,
S. Robin,
Workshop in bioinformatics and Statistical Genetics,
Goteborg, Sweden, May 9-13.
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Exact distribution for the local score of one i.i.d. random sequence,
S. Mercier,
JOBIM : Journées Ouvertes, Biologie, Informatique, Mathématique,
Montpellier, France, may 3-5.
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Comparaison de différentes approximations de la loi du comptage
d'un mot,
S. Robin and S. Schbath,
Poster at
JOBIM : Journées Ouvertes, Biologie, Informatique, Mathématique,
Montpellier, France, may 3-5.
Résumé
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A new method for protein classification based on motifs,
S. Schbath,
Electrophoresis Forum'99 , Rouen, France,
November 25.
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Looking for horizontal gene transfer in bacteria with hidden
Markov models,
F. Rodolphe,
Electrophoresis Forum'99 , Rouen, France,
November 25.
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Heterogeneity of bacterial genomes and Hidden Markov Models, (poster)
F. Muri,
Semstat, Séminaire Européen de Statistique,
Complex Stochastic Systems , Eurandom, Eindhoven, Pays-Bas,
March.
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Searching gene transfers on
Bacillus Subtilis using hidden Markov models,
Bize, L., Muri, F., Samson, F., Rodolphe, F., Ehrlich, S.D.,
Prum, B. and Bessieres, P.
In Recomb'99 Proceedings of
the Third Annual International
Conference on Computational Molecular Biology,
pages 43--49,
11-14 April 1999, Lyon, France.
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Exact Distribution of the Maximal Partial Sum
of Random Walks and application to a Local Score
Distribution for Statistical Analysis of Biological
Sequences.
Mercier, S.
Poster at Recomb'99, the Third Annual International
Conference on Computational Molecular Biology,
11-14 April 1999, Lyon, France.
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Détection de gènes eucaryotes par chaînes de Markov cachées,
D. Cellier, F. Muri,
Journées de Statistiques, SFdS, Grenoble, France,
May.
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Recherche de transferts de gènes chez les bactéries à l'aide de
chaînes de Markov cachées,
L. Bize, F. Muri, P. Bessières,
Journées de Statistiques, SFdS, Grenoble, France,
May.
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Loi Exacte de la distribution de motifs le long d'une séquence,
S. Robin,
Journées de Statistiques, SFdS, Grenoble, France,
May.
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How to find exceptional words in biological sequences,
S. Schbath,
Analyse Structurale et Fonctionnelle d'un génome,
Séminaire Algorithme et Biologie, Institut Pasteur, Paris,
December 8-10.
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Détection de régions homogènes de séquences
d'ADN et chaînes de Markov cachées.
F. Muri.
Animation d'un atelier : Recherche de transferts de gènes chez
les bactéries avec les chaînes de Markov cachées en
collaboration avec L. Bize, P. Bessières (Génétique Microbienne,
INRA).
École thématique du CNRS
``Traitement de l'information en génétique moléculaire'',
Asnelles-sur-mer, France,
November.
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Automatic clustering of large sequence databases,
Krause, A., Nicodème, P., Rehmsmeier, M. and Vingron, M.
German Conference on Bioinformatics GCB98, Koln, Germany,
October 7-10.
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Recherche de gènes dans les séquences biologiques des
eucaryotes supérieurs,
D. Cellier, F. Muri.
Journées MAS - SMAI,
Nice, Sophia-Antipolis, September.
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Distribution exacte des distances entre mots dans une suite aléatoire
de lettres,
J.-J. Daudin
Journées MAS - SMAI,
Nice, Sophia-Antipolis, September.
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Modelling bacterial genomes using hidden Markov models
,
Muri, F.,
XIII COMPSTAT Conference of the
International Association for Statistical Computing,
Bristol, Angleterre, August.
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Loi jointe des occurrences de mots multiples dans une
chaîne de Markov : deux applications en biologie moléculaire,
Schbath, S.,
Journées Statistique et Génome,
University of Evry, France, June 4.
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Approximation for counts of multiple words in biological sequences
,
Schbath, S.,
Workshop on Mathematical and Statistical Aspects of Molecular Biology,
University of Wales College of Medecine, Cardiff, GB, April 6-7.
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Statistical properties of word occurrences along genome sequences
,
Robin, S.,
Workshop on Mathematical and Statistical Aspects of Molecular Biology,
University of Wales College of Medecine, Cardiff, GB, April 6-7.
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R'MES: Software to detect Exceptional Motifs in DNA Sequences,
Schbath, S.,
RECOMB'98,
New York City, USA, March 22-25.
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Topics in mathematical analysis of genomes,
Schbath, S.,
Mathematics and Molecular Biology Seminar,
Stanford University, USA, March 18.
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Identification de régions homogènes de séquences d'ADN et
chaînes de Markov cachées.
F. Muri.
Séminaire du Laboratoire de Statistique et
Probabilité, Université Paul Sabatier, Toulouse, France,
February 1998.
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Identification de régions homogènes de séquences d'ADN et
chaînes de Markov cachées,
F. Muri.
Séminaire de l'IFR 69
d'Ile-de-France, Villejuif, France,
January.
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Predicting progress in a physical mapping project
by anchoring random clones using coverage processes,
Schbath S.,
ISI Satelite Meeting. Mathematical Statistics and its
Application to Biosciences,
Rostock, Germany,
August 31-September 4.
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Approximation of word counts in markov chains
,
Schbath S.,
Workshop on Mathematical Analysis of Biological Sequences,
University of Rouen, France, August 27-29.
(english abstract, 9 pages)
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Translation conditional models for coding sequences
,
(Modèles conditionnels à la traduction pour des séquences codantes)
Rodolphe F.,
Workshop on Mathematical Analysis of Biological Sequences,
University of Rouen, France, August 27-29.
(english abstract,
résumé français)
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Predicting progress in a physical mapping project
without homogeneity assumptions: Effects of inhomogeneity,
Schbath S.,
Bioinformatics Seminar,
University of Gent, Belgium, July 9.
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Statistical analysis of word occurrences in DNA sequences,
Turckheim É. de,
Workshop on Computational Biology,
Department of Applied Mathematics, University of Zurich,
May 22-23.
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Heterogeneity of DNA sequences and hidden Markov chains,
Muri, F.,
Probability Seminar,
University of Southern California, Los Angelès, USA, January 24.
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Heterogeneity of DNA sequences and hidden Markov chains,
Muri, F.,
Program in Mathematics and Molecular Biology V,
(PMMB),
"Statistics and Inference
in Molecular Biology",
Santa Fe, USA, January 14-19.
(1 page abstract).
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Predicting progress in physical mapping projects: Effects of inhomogeneity
,
Schbath, S.,
Program in Mathematics and Molecular Biology V,
(PMMB),
"Statistics and Inference
in Molecular Biology",
Santa Fe, USA, January 14-19.
(1 page abstract).
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Comparaison de séquences,
Cellier, D.,
Journées MAS-SMAI, Toulouse, France, September.
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Analyse des séquences d'ADN et chaînes de
Markov cachées.
Prum, B., Muri,F.,
Séminaire de Statistique appliquée
.
Lausanne, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, May 1996.
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Hétérogéneité des séquences
d'ADN et chaînes de Markov cachées,
Muri, F.,
Journées MAS-SMAI, Toulouse, France, September.
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Chaînes de Markov et analyse
statistique de génomes.
B. Prum, F. Muri, É. de Turckheim, F. Rodolphe, S. Schbath,
F. Gélis.
Colloque Franco-Roumain sur le thème
Analyse et Modélisation.
Cluj, Romania, September 1996.
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Analyse de séquences d'ADN et chaînes de Markov cachées,
Prum, B.,
Séminaire de Statistique, École Polytechnique Fédérale de Lausanne,
Lausanne, Switzerland, May 31.
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Rigorous mathematical tools for searching exceptional words in DNA
sequences,
Prum, B.,
Mathematical Analysis of Biological Sequences,
Trondheim, Norway, August 4-6 .
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L'analyse statistique rigoureuse des séquences biologiques,
Prum, B.,
Colloque franco-roumain, Cluj, Romania, September 26.
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Recherche de mots exceptionnels dans les séquences d'ADN,
Rodolphe, F.,
Analyse Informatisée des Séquences, Toulouse, France, October 18.
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Statistics of word counts in a Markov chain and
application to identify words with unexpected frequencies in DNA
sequences,
Schbath, S.,
Probability and Statistics Seminar, University of Southern
California, Los Angeles, USA, April 5.
-
Statistics of word counts in a Markov chain and
application to identify words with unexpected frequencies in DNA
sequences,
Schbath, S.,
Statistics Seminar, Stanford University, USA, October 9.
(1 page abstract)
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Taking into account non-homogeneity in physical mapping
by anchoring random clones: Mathematical analysis and application to
hotspots,
Schbath, S.,
Mathematical Biology Seminar, Berkeley University, USA, October 10.
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Analyse des fréquences de mots dans les séquences d'ADN,
Turckheim, É. de,
Journées MAS-SMAI, Toulouse, France, September.
-
Hétérogénéité des séquences d'ADN et chaînes de Markov
cachées,
Muri, F.,
XXVIIèmes Journées de Statistique, Association
pour la Statistique et ses Utilisations,
Jouy-en-Josas, France, May 15-19. (2 pages abstract)
-
Heterogeneity of DNA sequences and hidden Markov chains,
Muri, F.,
21st European Meeting of Statisticians,
Aarhus University, Aarhus,
Denmark, August 21-25. (1 page abstract)
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Statistique et génome : l'exemple de la recherche d'oligonucléotides
de fréquence exceptionnelle,
Prum, B.,
École thématique du CNRS, Université de Rouen, France,
September 26.
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Statistics of counts of words in DNA sequences,
Schbath, S.,
21st European Meeting of Statisticians,
Aarhus University, Aarhus,
Denmark, August 21-25. (1 page abstract)
-
Statistiques des comptages de mots dans
les séquences d'ADN,
Schbath, S.,
XXVIIèmes Journées de Statistique, Association
pour la Statistique et ses Utilisations,
Jouy-en-Josas, France, May 15-19. (4 pages abstract)
-
Statistiques des comptages de mots dans les séquences d'ADN,
Schbath, S.,
Séminaire de Statistique, École Polytechnique Fédérale de Lausanne,
Lausanne, Switzerland, May 19.
-
Détection de ruptures dans les séquences d'ADN et
chaînes de Markov cachées,
Muri, F.,
Forum InterDisciplinaire "Génome et
Informatique", GREG et GDR "Informatique et Génomes",
Aussois, France, June 15-17.
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Statistique en analyse du génome, ses apports, ses
limites,
Prum, B.,
Statistiques dans une séquence de nucléotides, GREG et GDR
"Informatique et Génomes", Paris, France, May 11.
-
Recherche de motifs de fréquence exceptionnelle
dans les séquences d'ADN,
Schbath, S.,
Forum InterDisciplinaire "Génome et
Informatique", GREG et GDR "Informatique et Génomes",
Aussois, France, June 15-17. (1 page abstract)
-
Étude des comptages de mots dans des sequences
d'ADN et approximations par des lois de Poisson,
Schbath, S.,
XXVIèmes Journées
de Statistique, Association pour la Statistique et ses Utilisations,
Neuchâtel, Switzerland, May 24-27. (3 pages abstract)
-
Identification de motifs exceptionnels par
l'étude statistique des comptages de "trains",
Schbath, S.,
Recherche de Motifs
dans les Séquences, GREG et GDR "Informatique et Génomes",
Marseille, France, February 24-25.
-
À la recherche de mots exceptionnels dans le
génome,
Prum B.,
Recherche de Motifs dans les Séquences, GREG et GDR
"Informatique et Génomes", Marseille, France, March 4-5.
-
Finding exceptional words in DNA
sequences,
Turckheim, É. de,
Workshop on Mathematical and statistical aspects of
molecular biology, Oxford, Great Britain.
-
Statistical analysis of motifs in DNA
sequences,
Turckheim, É. de,
Séminaire de Probabilités et Statistique, Giessen-Marburg,
Germany.
-
Statistical analysis of motifs in DNA
sequences,
Turckheim, É. de,
Workshop on Molecular Sequence Analysis, Stanford University, USA.
-
Statistical analysis of motifs in DNA
sequences,
Turckheim, É. de,
ISI meeting, Florence, Italy.
-
Statistical problems in Molecular Biology,
Turckheim, É. de,
Lunteren meeting, Nederland, November 15-17.
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Séminaires en France
Communications in French seminars
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Analyse de séquences d'ADN par chaines de Markov cachées,
Tocquet, A.-S. and Nicolas, P.,
Séminaire Statistique et Biologie, Ecole Normale Supérieure, Paris,
04 février.
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Répartition de motifs dans des séquences ADN,
Robin, S.,
Séminaire Statistique et Biologie, Ecole Normale Supérieure, Paris,
04 février.
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Sur- ou sous-représentation des oligonucléotides dans les génomes :
méthodes statistiques et comparaison,
Schbath, S.,
Séminaire de Probabilités, Université de Nancy,
13 décembre.
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Sur- ou sous-représentation des oligonucléotides dans les génomes :
méthodes statistiques et comparaison,
Schbath, S.,
Séminaire Statistique et Biologie, Ecole Normale Supérieure, Paris,
05 novembre.
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Sur- ou sous-représentation des oligonucléotides dans les génomes :
méthodes statistiques et comparaison,
Schbath, S.,
Séminaire Méthodes Probabilistes en Biologie Moléculaire ,
18 octobre.
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Occurences de motifs dans des séquences d'ADN ,
Robin, S.,
Séminaire de l'Unité de Biométrie et Intelligence Artificielle de
l'INRA, Jouy en Josas, 15 janvier.
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Loi jointe des occurrences de mots multiples dans
une chaine de Markov:
deux applications en Biologie Moleculaire,
Schbath S.,
Journées Statistiques et Génome, Université d'Évry, 4 Juin.
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Un emploi de U-statistiques pour rechercher des répétitions dans
des séquences génétiques,
Prum, B.,
Journées Statistiques et Génome, Université d'Évry, 4 Juin.
-
Prédiction en cartographie physique des génomes : modèle homogène
versus modèle inhomogène.
Schbath S.,
Institut National d'Agronomie, Paris, 5 mai.
-
Recherche de mots de frequence
exceptionnelle dans les sequences d'ADN
codantes. Approximation de Poisson et de
Gauss dans des chaines de Markov conditionnees.
Mercier S.,
UPRES-A 6085, janvier 1997.
-
Analyse des séquences d'ADN et chaînes de Markov cachées.
Muri F.,
IUT de Paris V, Paris,
20 mars.
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Méthodes MCMC pour l'analyse de séquences d'ADN.
Muri, F.,
Journée "Computational Statistics",
Laboratoire de Statistique du CREST, Malakoff, 30 Avril.
-
Analyse des séquences d'ADN et chaînes de Markov cachées.
Muri F.,
Journée d'exposés sur les chaînes de Markov cachées,
Université d'Evry Val d'Essonne,
24 avril.
-
Méthodes MCMC pour l'analyse de
séquences d'ADN.
Muri F.,
Journée Computational Statistics,
CREST, April 1997.
-
Algorithmes stochastiques appliqués au génome.
Muri F.,
ISDF, Groupe
Recherche Méthodologique,
Université de Marne-La-Vallée, June 1997.
-
Identification de régions homogènes de séquences d'ADN et
chaînes de Markov cachées.
Muri F.,
Journée Biométrie,
Hôpital de la Salpêtrière, November 1997.
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Processus de recouvrements et cartographie physique des génomes.
Schbath S.,
Séminaire de Modélisation Stochastique,
Université Paris VI, Jussieu, Paris, 23 Avril.
-
Occurrences de mots dans une séquence aléatoire de lettres (II).,
Daudin J.J.,
Institut National d'Agronomie, Paris, 14 avril.
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Occurrences de mots dans une séquence aléatoire de lettres (I).,
Robin S.,
Institut National d'Agronomie, Paris, 7 avril.
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Processus de recouvrements et cartographie physique des génomes.
Schbath S.,
Séminaire de Probabilités et Statistique,
Université Paris-Sud, Orsay, 20 mars.
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Comparaison des prédictions d'un projet
de cartographie physique par méthode d'ancrage, en présence ou absence
d'hypothèses d'homogenéité le long du génome.
Schbath S.,
Séminaire Algorithmes, INRIA
Rocquencourt, 10 février.
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Échantillonnage par couplage de
chaînes de Markov..
Cellier, D. Muri, F.
(en collaboration avec C. Guihenneuc-Jouyaux et V. Lasserre, UA1323)
Séminaire de Statistique Médicale, Université Paris
V, Mai 1996.
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Couplage et méthodes de Monte Carlo par
Chaînes de Markov.
Cellier, D., Muri,F.,
(en collaboration avec C. Guihenneuc-Jouyaux et V. Lasserre, UA1323)
IMAG, Grenoble, France, Mars 1996.
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R'MES : méthode et illustrations,
Gélis, F. and Schbath, S.
Séminaire ABISS, Université de Rouen, Rouen, 12 janvier.
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À la recherche de mots exceptionnels,
Prum, B.,
Institut National d'Agronomie, Paris, 25 janvier.
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L'analyse statistique par chaînes de Markov des séquences d'ADN,
Prum, B.,
Université de Nancy, Nancy, 14 novembre.
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Problèmes combinatoires dans la recherche de
motifs exceptionnels dans les séquences d'ADN,
Schbath, S.,
Séminaire Automates et Théorie des Nombres, École Normale
Supérieure, Paris, 18 avril.
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Statistiques des comptages de mots dans les séquences d'ADN,
Schbath, S. and Turckheim É. de,
Séminaire de Probabilités et Statistiques, Université de Rouen,
3 novembre.
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Approximations de Poisson pour des comptages de mots
dans des séquences d'ADN,
Schbath, S.,
Séminaire de Probabilités et Statistiques, Université Paris-Sud,
Orsay, 17 novembre.
-
Approximations de Poisson pour des comptages de mots
dans des séquences d'ADN
Schbath, S.,
Séminaire de Statistique, CREST, Malakoff, 5 décembre.